Eine der zentralen Fragen betrifft die wahre Natur des Kalifats. Es wird häufig sowohl als spirituelle als auch politische Institution betrachtet, doch dies stellt ein Missverständnis dar. Was bedeutet es tatsächlich, Kalif zu sein? Im Arabischen bedeutet "Khalifa" Nachfolger oder Stellvertreter. Ein Kalif wird von Gott ernannt, um einen Propheten zu beerben und dessen Mission fortzuführen. Daher sind alle Versuche, ein Kalifat aus eigener Kraft zu etablieren, vergeblich und zum Scheitern verurteilt.
Seine Heiligkeit Hadhrat Mirza Masroor Ahmad (aba) äußerte sich zu diesem Thema folgendermaßen:
„Das Kalifat hat keine Beziehung zur Regierung oder Politik. Wenn sich die Ahmadiyya-Gemeinschaft weiter verbreitet, wird das Kalifat keine Rolle in der Regierung spielen und sich niemals in staatliche Angelegenheiten einmischen. Wir hegen keinerlei politische Ambitionen. Unsere Überzeugung liegt in der vollständigen Trennung von Religion und Staat.“
Diese Aussagen verdeutlichen, dass das Kalifat in seiner Essenz eine spirituelle und keine politische Institution ist. Es ist dazu bestimmt, die geistige Mission eines Propheten fortzusetzen, nicht jedoch weltliche Macht oder politische Kontrolle auszuüben. Somit sind das Kalifat und die Demokratie nicht nur vereinbar, sondern operieren in völlig getrennten Sphären – das eine im Bereich des Glaubens und der spirituellen Führung, das andere im Bereich der weltlichen Regierung und der politischen Verwaltung.